GATK* - Genome Analysis Tool Kit*

Bwa single end reads

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    Phylogenetics and paleogenomics show genomic rearrangements across legumes and suggest a major role for repetitive elements in pea genome evolution. Compared to other sequenced Leguminosae genomes, the pea genome shows intense gene dynamics, most likely associated with genome size expansion when the Fabeae diverged from its sister tribes. During Pisum evolution, translocation and transposition differentially occurred across lineages. This reference sequence will accelerate our understanding of the molecular basis of agronomically important traits and support crop improvement.

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    • Durch Repeats und Sequenzierfehler ist dies jedoch im Allgemeinen nicht möglich, daher beschränkt man sich auf die Suche von einer oder mehreren "gut passenden" Positionen.
    • It can also be compressed to create BCF format to save space.
    • GATK* - Genome Analysis Tool Kit*
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    • A reference genome for pea provides insight into legume genome evolution | Nature Genetics

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